Джейкоб с детства слушал истории дедушки о приюте для детей с необычными способностями. Там жили девочка, управляющая огнём, невидимый мальчик, парящая в воздухе девочка и другие удивительные дети. После загадочной смерти дедушки 16-летний Джейкоб получает письмо, которое приводит его на отдалённый остров. На этом таинственном месте он обнаруживает, что рассказы были правдой: дети из фотографий существуют. Под покровительством мисс Перегрин, которая защищает их от внешнего мира, они живут в петле времени. Джейкобу предстоит раскрыть собственный дар, чтобы помочь новым друзьям противостоять тёмным силам, угрожающим их дому.