Люди в чёрном — секретные защитники Земли от инопланетных угроз — сталкиваются с новым вызовом. На этот раз опасность исходит не только из глубин Вселенной, но и изнутри самой организации. Агентов отправляют по всему миру, чтобы обезвредить невидимого врага и предотвратить катастрофу. Однако борьба с предателем в их собственных рядах усложняет задачу. Новобранка М и опытный агент Эйч должны объединить силы, чтобы спасти планету, раскрыть тайну шпиона и доказать, что настоящие герои всегда найдут способ победить.